实行校、院两级管理和中心主任负责制，中心成立了由分管教学副校长牵头的，教务处、资产与实验室管理处、人力资源管理部、财务处、科研处等部门负责人为成员的实验室工作委员会。

实验教学中心实行学院领导下的主任负责制。实验教学中心 主任全面负责实验教学中心的建设、运行、改革与质量管理等工作。实验教学中心均成立了教学指导委员会，每年召开教指委会议，教指委负责审议示范中心的人才培养目标、实验教学体系、 重大教学改革项目、重大对外开放交流活动、年度报告等。

实验教学中心实行科学、规范的开放管理机制。中心所有实验室在中实验课以外的时间全部对外开放，学生可按照中心规范的程序与相关实验管理人员进行预约，在相关老师的指导下进行实验。实验教学开放运行，保障措施落实得力，中心运行良好。中心实行责任制管理，根据实验课程的设置情况设若干实验室与办公室，各实验室管理人员负责该实验室仪器设备的日常维护、实验课的准备以及 实验室开放等工作。实验教学考评办法科学合理，鼓励教师积极投入和改革创新。实验教学教师与实验室管理人员均按学校相关岗位职责进行考核，以保证示范中心的教学质量。实验教学质量保证体系完善。